Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F3O00716 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms