Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
STX16-NPEPL1H3BU86 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms