Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP99D6REC4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms