Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms