Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms