Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDR42E2A6NKP2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms