Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms