Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCAF1Q9Y4C2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms