Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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