Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SMIM7-214ENST00000597711 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CACNB2-214ENST00000612743 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AC010894.5-201ENST00000624428 951 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TPTE2P1-202ENST00000429698 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSUH2Q9Y2M2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms