Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms