Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms