Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms