Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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