Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms