Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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