Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DKK2Q9UBU2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms