Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms