Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP35Q9P2H5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP35Q9P2H5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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