Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXXC1Q9P0U4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms