Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMMDC1Q9NPL8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms