Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms