Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms