Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM4Q9C037 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms