Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF17Q9BXT8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms