Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms