Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

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Length 831 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SORT1Q99523 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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