Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF12Q99081 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms