Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSPG4P5Q96PW8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms