Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf72Q96LT7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms