Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM47Q96LD4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM47Q96LD4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms