Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms