Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms