Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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