Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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TTC21AQ8NDW8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TTC21AQ8NDW8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TTC21AQ8NDW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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TTC21AQ8NDW8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTC21AQ8NDW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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