Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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AMER3Q8N944 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AMER3Q8N944 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AMER3Q8N944 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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AMER3Q8N944 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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AMER3Q8N944 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AMER3Q8N944 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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