Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM48Q8IWZ4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM48Q8IWZ4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms