Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECW1Q76N89 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms