Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms