Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC27A3Q5K4L6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms