Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNT1Q5JUK3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms