Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1Q5JRX3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1Q5JRX3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1Q5JRX3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1Q5JRX3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITRM1Q5JRX3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms