Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms