Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALFQ53S48 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms