Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACSM3Q53FZ2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms