Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms