Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC142Q17RM4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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