Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RTL8BQ17RB0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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