Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN3Q16667 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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