Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDK4Q16654 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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